Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trub1Q8C0D0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trub1Q8C0D0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trub1Q8C0D0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trub1Q8C0D0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trub1Q8C0D0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trub1Q8C0D0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trub1Q8C0D0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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