Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Fam53cQ8BXQ8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam53cQ8BXQ8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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