Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms