Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ctdsp2Q8BX07 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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