Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms