Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BP99 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Q8BP99 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8BP99 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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