Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hirip3Q8BLH7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms