Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpa1Q8BLA8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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