Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms