Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup93Q8BJ71 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup93Q8BJ71 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms