Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms