Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smndc1Q8BGT7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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