Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmtc4Q8BG19 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms