Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms