Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms