Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actr5Q80US4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms