Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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