Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NischQ80TM9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NischQ80TM9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms