Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms