Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms