Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LnpkQ7TQ95 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms