Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp397Q7TNK4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms