Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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