Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SynmQ70IV5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SynmQ70IV5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms