Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sned1Q70E20 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sned1Q70E20 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms