Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpopQ6ZWS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms