Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Glis3Q6XP49 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Glis3Q6XP49 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms