Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms