Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms