Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rasa4Q6PFQ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rasa4Q6PFQ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms