Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrlQ6PE55 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms