Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms