Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sarm1Q6PDS3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms