Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbtb40Q6PCS8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms