Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Herc4Q6PAV2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Herc4Q6PAV2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms