Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gapvd1Q6PAR5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms