Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac10Q6P3E7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms