Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slx4Q6P1D7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slx4Q6P1D7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms