Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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