Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SphkapQ6NSW3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms