Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms