Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc66Q6NS45 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc66Q6NS45 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms