Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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NipblQ6KCD5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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NipblQ6KCD5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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NipblQ6KCD5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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