Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sohlh1Q6IUP1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms