Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf6Q6IR41 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms