Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms