Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KdsrQ6GV12 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KdsrQ6GV12 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms