Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TroQ6DIC6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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TroQ6DIC6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TroQ6DIC6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TroQ6DIC6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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