Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cep290Q6A078 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep290Q6A078 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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