Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top2bQ64511 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top2bQ64511 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms